在医药行业中，柠檬酸可以和碳酸钠或碳酸氢钠水溶液反应产生大量 CO2，用作泡腾体系，可以使药物活性成分迅速溶解并改善味觉效果。此外柠檬酸还可用于各种营养口服液中，作为缓冲剂。中药制剂中加入少量柠檬酸可形成微量铁铜金属络合物，延缓活性成分的降解。柠檬酸的各种盐还可补充相应的元素，酸根可以参与新陈代谢无残留。如柠檬酸铁铵和柠檬酸亚铁是温和的补铁剂，柠檬酸钙可以作为钙的强化剂，柠檬酸钾是一种补钾剂，同时可以在体内代谢形成醋酸钾，由肾脏排出，从而增加血液和尿的碱性，用于治疗膀胱炎和糖尿病所致的酸中毒。柠檬酸钠是抗凝血剂，广泛用于输血，血液和血浆的保存以及人造血浆和血制品的加工。